Представительный орган местного самоуправления - Совет депутатов муниципального образования городское поселение Заполярный. Избран 30 октября 2005 года на муниципальных выборах (первый созыв) на 4 года. Срок полномочий истекает в октябре 2009 года. Установлено 15 депутатов, избрано 15.
Глава муниципального образования городское поселение Заполярный -
Огиенко Владимир Федорович. Избран из состава Совета депутатов, исполняет полномочия Председателя Совета депутатов муниципального образования городское поселение Заполярный.
Исполнительно-распорядительный орган МСУ - администрация муниципального образования городское поселение Заполярный. Глава администрации –
Пищулин Борис Валентинович. Назначен по контракту по конкурсу 14 апреля 2006 года.